研究人员构建癌症eRNA表达图谱并揭示其在癌症临床中的应用

2019年10月8日，德克萨斯大学休斯敦健康研究中心的韩冷、李文博课题组合作在Nature Communications上在线发表题为“Transcriptionallandscape and clinical utility of enhancer RNAs for eRNA-targeted therapy incancer”的研究。该研究构建了迄今为止最完整的癌症增强子RNA(eRNA)图谱并揭示了eRNA在癌症临床中的潜在应用。

该项研究通过检测eRNA在约1万名癌症病人及约1000个癌症细胞系中的表达构建了目前为止最全面的癌症eRNA图谱，揭示了eRNA的癌症特异性表达/癌症种系特异性表达的特征，同时强调了eRNA作为生物标记物在不同类型癌症临床上的应用。通过研究eRNA与转录因子之间的共表达关系，发现eRNA的特异性表达与转录因子特异性调控密切相关。通过分析eRNA与编码基因之间的基因组距离及表达相关性并结合多组Hi-C数据加以佐证，该研究构建了eRNA的调控网络，揭示了eRNA在调控致癌信号通路及调节癌症临床治疗基因中的关键作用。此外，该研究通过调查eRNA与抗癌化合物之间的关系，首次证实eRNA可影响癌症细胞对抗癌药物的敏感性和抵抗性，且该影响可能会关联到相关的一条或多条癌症信号通路。

这项研究拓展了该领域对癌症基因转录调控的认知，探索了基于靶向eRNA的癌症治疗及联合治疗方案，开拓了癌症治疗新思路。